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我國(guó)研發(fā)CoHIT檢測(cè)平臺(tái):一種簡(jiǎn)便、快速、精準(zhǔn)的CRISPR基因檢測(cè)技術(shù)
2024年06月27日 16:04:42 來(lái)源:化工儀器網(wǎng) 點(diǎn)擊量:9008

中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研發(fā)一種名為CoHIT的新型CRISPR檢測(cè)平臺(tái),該平臺(tái)能夠快速、精準(zhǔn)地檢測(cè)同一基因位點(diǎn)上多種不同類(lèi)型的突變(indels)。

  【化工儀器網(wǎng) 項(xiàng)目成果】中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室深圳分中心)攜手武漢大學(xué)中南醫(yī)院,在《自然·通訊(Nature Communications)》期刊上發(fā)表了一項(xiàng)重大研究成果。該論文題為“CoHIT: a one-pot ultrasensitive ERA-CRISPR system for detecting multiple same-site indels”,介紹了一種名為CoHIT的新型CRISPR檢測(cè)平臺(tái),該平臺(tái)能夠快速、精準(zhǔn)地檢測(cè)同一基因位點(diǎn)上多種不同類(lèi)型的突變(indels)。
 
  快速靈敏檢測(cè)技術(shù)對(duì)疾病防控必不可少近年來(lái),以CRISPR/Cas為代表的基因編輯技術(shù)帶來(lái)了生物技術(shù)革命性的進(jìn)步。CRISPR的核酸檢測(cè)技術(shù)因其快速、準(zhǔn)確、靈敏、經(jīng)濟(jì)等特點(diǎn),正在引發(fā)分子診斷革新,并已被成功應(yīng)用于傳染病、遺傳病、腫瘤基因突變?cè)\斷,以及食品安全等領(lǐng)域。
 
  但現(xiàn)有的檢測(cè)方法在應(yīng)對(duì)同一基因位點(diǎn)的多種indels時(shí)往往存在檢測(cè)覆蓋率不足的局限性。為了克服這一挑戰(zhàn),研究團(tuán)隊(duì)利用蛋白進(jìn)化技術(shù),篩選出高耐受度的Cas蛋白,并結(jié)合單一crRNA識(shí)別多種突變類(lèi)型的創(chuàng)新理念,成功構(gòu)建了CoHIT檢測(cè)平臺(tái)。
 
  CoHIT系統(tǒng)的核心在于一種改良的AsCas12a蛋白,即enAsU-R。這種蛋白僅需一條crRNA就能靶向多個(gè)不同的變異體,有效提高了檢測(cè)的靈敏度和特異性。通過(guò)一系列參數(shù)優(yōu)化,CoHIT技術(shù)對(duì)NPM1基因突變的常見(jiàn)亞型達(dá)到了0.01%的檢測(cè)靈敏度,并在30分鐘內(nèi)快速給出結(jié)果,為急性髓系白血病(AML)患者的NPM1突變檢測(cè)提供了新的解決方案,且在監(jiān)測(cè)微小殘留病灶(MRD)方面展現(xiàn)了巨大的潛力。
 
  值得一提的是,CoHIT技術(shù)還具備出色的適應(yīng)性和多重檢測(cè)能力。通過(guò)與側(cè)向流檢測(cè)條(LFA)和微流控芯片的結(jié)合,該技術(shù)不僅實(shí)現(xiàn)了現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè),還能夠在一次上樣中同時(shí)檢測(cè)多個(gè)靶標(biāo),為疾病的早期診斷和食品安全監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域提供了強(qiáng)大的技術(shù)支持。
 
  CoHIT技術(shù)的成功研發(fā)和不斷優(yōu)化,不僅簡(jiǎn)化了檢測(cè)流程,還大大提升了檢測(cè)速度與準(zhǔn)確性,為分子育種、疾病早期診斷、遺傳病篩查和食品安全監(jiān)測(cè)等眾多領(lǐng)域提供了強(qiáng)有力的工具。
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