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為什么Edman降解仍然重要?探索其不可

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百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質(zhì)譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(zhì)(包括蛋白質(zhì)、多肽、代謝物)質(zhì)譜分析以及小分子物質(zhì)檢測服務(wù)。

l 公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,專業(yè)提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

l 獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

l 業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

l 7大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

l 服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

l 致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!






業(yè)務(wù)范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務(wù),為客戶提供高性價比、高效率的技術(shù)服務(wù)。

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為什么Edman降解仍然重要?探索其不可替代的應(yīng)用場景檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在質(zhì)譜技術(shù)主導(dǎo)dànbáizhì組學(xué)的時代,Edman降解似乎成了“過去式”。但事實并非如此。作為一種經(jīng)典且jīngzhǔn的N端dànbáizhì測序方法,Edman降解在多個關(guān)鍵場景中依然有著bùkětìdài的價值,尤其是在dànbáizhì結(jié)構(gòu)驗證、藥物質(zhì)量控制以及非模式生物的研究中。本文將深入解析Edman降解的原理與優(yōu)勢,剖析其在現(xiàn)代科研與生物醫(yī)藥中的dútè應(yīng)用場景,并探討如何與質(zhì)譜技術(shù)形成互補,發(fā)揮zuì大效能。


一、什么是Edman降解?

Edman降解是一種用于確定dànbáizhì或多肽N端氨基酸序列的化學(xué)方法,由瑞典生物化學(xué)家Pehr Edman于1950年開發(fā)。其基本原理包括三步:

1、N端氨基酸與苯異硫氰酸(PITC)反應(yīng);

2、形成環(huán)狀衍生物并在酸性條件下斷裂,釋放出shǒugè氨基酸(以PTH衍生物形式);

3、使用HPLC對PTH-氨基酸進行鑒定。

??這種逐步“讀取”N端序列的方式,zuì多可測定約30個氨基酸,在高純度樣品中具有jígāo的準(zhǔn)確率。


二、為什么Edman降解仍然bùkěhuòquē?

盡管質(zhì)譜具有高通量和高靈敏度等優(yōu)勢,但在以下幾個關(guān)鍵應(yīng)用中,Edman降解仍展現(xiàn)出其他方法難以替代的dútè價值:

1、N端驗證:確保蛋白翻譯起始位點準(zhǔn)確

在表達與純化dànbáizhì時,科學(xué)家常常需要確認(rèn)是否從正確的起始密碼子開始翻譯,是否存在N端延伸或截斷。這在設(shè)計功能蛋白、重組抗體、疫苗時尤為關(guān)鍵。


  • 質(zhì)譜在識別復(fù)雜翻譯后修飾或N端微小變化時可能受限;

  • 而Edman降解能直接讀取N端序列本身,無需依賴數(shù)據(jù)庫,結(jié)論更具確定性。


??典型應(yīng)用:確認(rèn)抗體重鏈/輕鏈?zhǔn)欠裼蓄~外的起始氨基酸,判斷表達系統(tǒng)中信號肽是否被準(zhǔn)確切除。


2、蛋白藥物研發(fā)與生產(chǎn):構(gòu)建穩(wěn)定可靠的質(zhì)量體系

在生物藥開發(fā)過程中,dànbáizhì結(jié)構(gòu)一致性是質(zhì)量控制的核心環(huán)節(jié)。無論是藥物發(fā)現(xiàn)階段的初始篩選,還是后期的中試放大與生產(chǎn)批次穩(wěn)定性評估,Nduāncèxù都是重要的驗證手段。


  • Edman降解可用于確認(rèn)dànbáizhì起始序列是否符合設(shè)計;

  • 幫助研發(fā)人員判斷表達系統(tǒng)是否導(dǎo)致非預(yù)期的氨基酸修飾或切除。


3、凝膠條帶鑒定:驗證目標(biāo)蛋白身份,排查雜帶干擾

在SDS-PAGE或2D凝膠中,即使某條蛋白條帶看似純凈,其真實組成仍可能包含多種蛋白。直接將條帶切下并進行Edman測序,可以快速判斷其主成分是否為目標(biāo)蛋白。


  • 不同于質(zhì)譜常見的“混合肽段分析”,Edman可線性讀取蛋白N端序列,對單一主帶蛋白尤為jīngzhǔn;

  • 在抗原制備、蛋白純度驗證等實驗中,提供直觀可追溯的結(jié)構(gòu)信息。


4、非模式生物研究:無需數(shù)據(jù)庫,獲取原始序列信息

質(zhì)譜依賴數(shù)據(jù)庫進行肽段匹配,而對于尚無完整基因組信息的非模式物種(如某些植物、微生物或海洋生物),這種方法存在明顯局限。


  • Edman降解則以化學(xué)方式直接讀取N端序列,不依賴任何背景信息;

  • 是非模式物種中新蛋白發(fā)現(xiàn)與初步結(jié)構(gòu)鑒定的重要手段。


三、Edman降解的局限性及zuìjiā應(yīng)用策略

雖然Edman降解具有dútè優(yōu)勢,但它也存在一些技術(shù)限制:


為什么Edman降解仍然重要?探索其不可


因此,科研和工業(yè)界更傾向于采用“Edman + 質(zhì)譜”雙策略:


  • 用Edman降解jīngquè定義dànbáizhìN端序列;

  • 用質(zhì)譜補足中段與C端序列,實現(xiàn)全序列確認(rèn)。


Edman降解依然是dànbáizhì測序中zuì具確定性的一環(huán),在對結(jié)果精度要求jígāo的場景下,它不僅是對質(zhì)譜結(jié)果的重要補充,更是某些關(guān)鍵節(jié)點上的“wéiyī選擇”。百泰派克生物科技致力于提供高質(zhì)量的基于Edman降解的蛋白N端序列分析服務(wù),幫助科研與產(chǎn)業(yè)客戶提升數(shù)據(jù)可信度,加快研發(fā)進程。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)先進,填補技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

為什么Edman降解仍然重要?探索其不可




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



為什么Edman降解仍然重要?探索其不可替代的應(yīng)用場景檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹



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