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dovetailgenomics 21006說明書
Dovetail™ Micro-C Kit
Catalogue #: 21006
規(guī)格
反應 | 8 |
驗證樣本 | 哺乳動物細胞 |
技術 | 嗝 |
標簽 | 僅供研究使用 |
應用程序 | 染色質(zhì)構象分析 |
Dovetail™ Micro-C Kit在鄰近連接之前使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 進行染色質(zhì)消化。該試劑盒提供了在生成 NGS 文庫之前對哺乳動物樣本進行鄰近連接步驟所需的所有試劑。該試劑盒與用于 Illumina 的 Dovetail™ 文庫模塊（貨號 #25004）和用于 Illumina 測序的第 3 方標準雙端文庫制備試劑盒兼容。
Dovetail Micro-C 套件具有以下主要優(yōu)點：
與序列無關的染色質(zhì)片段化甚至可以在全基因組范圍內(nèi)檢測染色質(zhì)接觸（使用基于限制性酶的 Hi-C 方法無法覆蓋多達 20% 的基因組）
染色質(zhì)接觸的超高核小體水平分辨率
最高的信噪比數(shù)據(jù)，同時豐富了遠程信息讀取和核小體保護片段
Dovetail Micro-C 庫豐富了所需的 Hi-C 特性
所述MNase酶既具有不依賴序列的內(nèi)切核酸酶和外切核酸酶活所以產(chǎn)生的片段是核小體的長度（146堿基對）。該協(xié)議的鄰近結扎部分經(jīng)過優(yōu)化，以最大限度地提高遠程交互。由此產(chǎn)生的高度均勻的短片段能夠?qū)崿F(xiàn)染色質(zhì)接觸的核小體水平分辨率，這是理論分辨率的最大值。
改進的拓撲特征調(diào)用
在鄰近連接數(shù)據(jù)中檢測更高階特征（例如染色質(zhì)環(huán)）的能力取決于豐富遠程信息讀取以捕獲染色質(zhì)相互作用頻率。與基于 RE 的方法相比，增加的染色體構象信息讀取結合超高分辨率改善了循環(huán)調(diào)用。
Dovetail Micro-C *地捕捉核小體定位
用MNase消化的染色質(zhì)顯示了在 Dovetail™ Micro-C 文庫中可見的全基因組核小體圖譜。該圖由與受核小體保護的 DNA 相關的序列讀取峰和代表可被MNase消化的干預 DNA 的谷組成。這種振蕩發(fā)生在 ~146 bp 的頻率（包裹在單核小體周圍的 DNA 長度）。此功能是 Micro-C 數(shù)據(jù)的，因為它在基于 RE 的方法中不存在。Dovetail™ Micro-C 實現(xiàn)的全基因組核小體定位和超分辨率染色體拓撲結構相結合，有助于從核小體到核小體染色質(zhì)接觸的映射。
