U-OPENSCREEN的化合物存儲和管理系統(tǒng)可以儲存并向不同地方的合作伙伴站點提供化合物樣本。該系統(tǒng)是一個由13臺儀器組成的自動化整合系統(tǒng),其中包括一臺Hamilton Verso®化合物管理設(shè)備和兩臺Hamilton Microlab® STAR(let) 液體處理工作站。整個系統(tǒng)由 Hamilton VENUS® 軟件控制,HMotion機械臂可實現(xiàn)設(shè)備間的運輸。在本案例中,我們將介紹如何使用該系統(tǒng)為EU-OPENSCREEN合作研究機構(gòu)的高通量篩選 (HTS) 研究分裝超過150萬份化合物。
關(guān)于EU-OPENSCREEN
EU-OPENSCREEN是一個成立于2018年的非營利性的歐洲研究基礎(chǔ)設(shè)施聯(lián)盟(ERIC),致力于化學(xué)生物學(xué)和早期藥物發(fā)現(xiàn)。該聯(lián)盟為化學(xué)工具開發(fā)項目的各個階段提供支持,包括實驗、高通量篩選以及對“先導(dǎo)"化合物進(jìn)行化學(xué)優(yōu)化。此外,它還運營著一個開放式數(shù)據(jù)庫和一個包含10萬多種常見化合物的化合物庫。EU-OPENSCREEN總監(jiān)Philip Gribbon博士評論道:“EU-OPENSCREEN致力于提高歐洲在科學(xué)研究和經(jīng)濟發(fā)展方面的全球地位。我們的服務(wù)可提供關(guān)鍵數(shù)據(jù),幫助識別和剔除篩選過程中的假陽性結(jié)果,從而篩選出有潛力的化合物進(jìn)行進(jìn)一步改進(jìn)。這一過程可確保篩選的結(jié)果是可靠、一致和可比較的,從而有助于建立早期藥物發(fā)現(xiàn)和臨床前研究的高標(biāo)準(zhǔn)。" 作為一家致力于推進(jìn)歐洲研究和藥物開發(fā)的組織,EU-OPENSCREEN作為一個分布式研究基礎(chǔ)設(shè)施運營,目前在歐洲擁有30多個合作伙伴站點。
EU-OPENSCREEN的化合物管理
EU-OPENSCREEN化合物儲存和管理設(shè)施位于德國柏林布赫總部,目前有16名員工。該設(shè)施負(fù)責(zé)向所有合作伙伴站點供應(yīng)化合物。EU-OPENSCREEN化合物管理負(fù)責(zé)人David Garcia Lopez評論說:“我們的主要工作是維護(hù)化合物庫,并以高通量方式(如384孔板和1536孔板)向篩選機構(gòu)提供化合物庫。這項工作需要廣泛的自動化,以實現(xiàn)高通量,同時確?;衔锏姆€(wěn)定性和可追溯性。"
系統(tǒng)概述
用于化合物處理的自動化系統(tǒng)包括Hamilton Verso®M2化合物管理系統(tǒng),該系統(tǒng)通過HMotion機械臂整合Hamilton Microlab®STAR和Microlab®STARlet液體處理工作站,LabElite®開關(guān)蓋機,離心機,LiCONiC LPX880板存儲等設(shè)備。一共有13臺設(shè)備整合到自動化系統(tǒng)中。負(fù)責(zé)該項目的Hamilton自動化國際項目負(fù)責(zé)人Karim Benyaa先生解釋了這些儀器之間的通信方式:“過去十五年來,Hamilton在整合第三方設(shè)備和開發(fā)復(fù)雜的自動化工作流程方面積累了豐富的經(jīng)驗。我們還與合作伙伴一起制定了一項溝通戰(zhàn)略,以便將我們的移液工作站輕松整合到其他復(fù)雜的系統(tǒng)中。就EU-OPENSCREEN而言,控制整個工藝流程的最大、最復(fù)雜的儀器就是Hamilton系統(tǒng)。其主要優(yōu)勢之一是Hamilton移液工作站VENUS®軟件與Hamilton自動樣品管理軟件INSTINCT®之間的直接通信。為了整合所有第三方設(shè)備,我們開發(fā)了專用的驅(qū)動程序,并將其集成到Hamilton VENUS® 軟件中,作為中央樞紐發(fā)揮作用"。
自動化方法描述
目前,系統(tǒng)中集成了十個自動化程序,每個程序都使用不同的儀器組合:
1. 化合物溶解和分裝
2. 將化合物放置-20°C的儲存中或從中取出
3. 96管架到384孔板化合物重排
4. 板分裝
5. 板復(fù)制
6. 隨機挑孔
7. 液體轉(zhuǎn)移質(zhì)量控制
8. LC-MS樣本制備
9. 梯度稀釋
10. 384孔板向1536孔板化合物重排
自動化的優(yōu)勢
通量
開發(fā)該自動化系統(tǒng)的目的是向所有篩查機構(gòu)提供EU-OPENSCREEN總部的化合物樣本(超過100,000 種化合物)。Lopez先生評論道:“自動化取得了成功。在一年半內(nèi),我們向我們的合作伙伴供應(yīng)了150多萬份化合物樣本,每份化合物庫約300塊板。如果沒有這套自動化系統(tǒng),我們根本無法實現(xiàn)這一目標(biāo)。此外,得益于我們的自動化存儲系統(tǒng),我們能夠安全地存儲、跟蹤和取出我們的化合物,而這一切只需很少的人工干預(yù)。
靈活性和可整合性
除了將化合物從96管架重排為384孔板的程序外,還在同一集成系統(tǒng)內(nèi)開發(fā)了其他9個程序。這種靈活性在很大程度上歸功于通過Hamilton VENUS® 軟件操作大多數(shù)儀器的能力。Specker博士評論道:“整合所有的設(shè)備是我們從一開始就確定的一項挑戰(zhàn),而Hamilton為我們提供可靠解決方案的能力是我們選擇他們作為供應(yīng)商的決定性因素。Hamilton團隊為我們提供了非常全面的系統(tǒng)概念,并在整個實施階段一直與我們同行,還有許多不斷變化的規(guī)定和不確定因素。此外,能夠?qū)⒋笮妥詣踊瘶悠饭芾硐到y(tǒng)與自動化生態(tài)系統(tǒng)的其他部分整合在一起,也是一個很好的提議"。
樣本可追溯性
整合系統(tǒng)的主要優(yōu)勢之一是,樣本始終可在工作流程中進(jìn)行追蹤。Benyaa先生評論道:“Verso®、開蓋機和STAR工作站都能讀取樣品的條形碼,從而實現(xiàn)了可靠的操作。此外,我們在VENUS®軟件中添加了一個功能,可以在移液后自動更新化合物瓶中的剩余體積。這有助于以后使用96頭進(jìn)行液體轉(zhuǎn)移,因為Microlab®STAR™確切地知道96管架管中的液位,并從這個高度開始吸液。這可以防止移液錯誤和移液量不正確。"
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