來自中國科學(xué)院上海藥物研究所，國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心（北京），國家癌癥中心，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院等處的中國科學(xué)家團隊近報告了一項針對103名中國肺腺癌（LUAD）患者的綜合蛋白質(zhì)組學(xué)分析，這一疾病是所有癌癥類型中的主要致死死因。

   這一發(fā)現(xiàn)公布在7月9日的Cell雜志上。研究揭示了與LUAD相關(guān)的分子特征，與臨床結(jié)果的關(guān)聯(lián)，潛在的預(yù)后生物標(biāo)志物和藥物靶標(biāo)等。

   盡管近年來LUAD的基因組研究在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域取得了顯著進展，但仍有很大一部分LUAD患者仍缺乏針對性的治療策略。由于蛋白質(zhì)是生物活動的直接執(zhí)行者，因此對LUAD的蛋白質(zhì)組學(xué)研究可以*基因組異常與致癌蛋白質(zhì)功能之間的知識鴻溝。

   為了全面了解LUAD的分子結(jié)構(gòu)，并為更準(zhǔn)確地診斷和治療LUAD提供幫助，在這項研究中，科學(xué)家們對103位LUAD患者的腫瘤組織，及其配對的非癌性相鄰組織進行了蛋白質(zhì)組和磷酸化蛋白質(zhì)組分析。他們總共鑒定出11,119個蛋白質(zhì)和22,564個磷酸化位點。將這些蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)與臨床信息和基因組學(xué)數(shù)據(jù)相結(jié)合，可獲得LUAD的全面分子圖譜。

   從中研究人員發(fā)現(xiàn)，上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化以及炎癥和致癌信號通路可能導(dǎo)致了I期LUAD的不良預(yù)后。他們進一步確定了中國LUAD患者的兩個主要驅(qū)動基因——EGFR或TP53突變的患者的遺傳變異與蛋白質(zhì)組學(xué)特征之間的聯(lián)系。

   EGFR突變患者中觀察到兩種組織學(xué)標(biāo)志物：TTF-1和Napsin-A，以及剪接體中蛋白質(zhì)的表達水平升高。 TP53突變的患者中，包括DNA復(fù)制和錯配修復(fù)在內(nèi)的幾種致癌途徑發(fā)生了顯著變化。

   值得注意的是，研究人員將所有患者分為三種蛋白質(zhì)組學(xué)亞型（S-I，S-II，S-III），每種亞型均具有*的分子特征和臨床特征。

   全面的生物信息學(xué)分析表明，S-1患者與細胞環(huán)境和良好的預(yù)后相關(guān)。相比之下，S-III患者與細胞增殖和蛋白質(zhì)組穩(wěn)定性以及預(yù)后不良有關(guān)。磷酸蛋白質(zhì)組學(xué)分析進一步揭示了不同蛋白質(zhì)組學(xué)亞型中激活的信號通路和激酶。

   蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)的綜合分析進一步揭示了27種潛在的血漿生物標(biāo)志物和LUAD的幾種藥物靶標(biāo)。 HSP90β是潛在的生物標(biāo)志物之一，已在獨立隊列中開始進一步驗證。

   這項研究提供了對LUAD的新見解，超越了當(dāng)前的基因組見解。蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)集可作為寶貴而強大的資源，用于加速將基礎(chǔ)研究轉(zhuǎn)化為臨床實踐更精細的診斷和治療方法。

                        ------ 文章摘自 生物通 ------