端粒由高度重復(fù)的 DNA 序列(如人類的(TTAGGG)n)與特定蛋白復(fù)合體構(gòu)成,它為染色體末端提供了穩(wěn)固的保護(hù)屏障,避免其在細(xì)胞分裂過程中受到侵蝕與降解。
研究表明,端粒長度與衰老、癌癥、神經(jīng)退行性疾病等多種疾病存在著千絲萬縷的聯(lián)系。從胎兒到老年人,人體細(xì)胞的端粒長度隨著年齡增長而呈現(xiàn)縮短趨勢,它就像一個(gè)伴隨著生命歷程的隱形時(shí)鐘,記錄著細(xì)胞的繁衍與衰老軌跡,全血端粒長度甚至可作為其他人體組織端粒長度的替代指標(biāo),為評估個(gè)體健康狀況和疾病風(fēng)險(xiǎn)提供了重要依據(jù)。
端粒長度檢測的方法有哪些
TRF法檢測端粒長度 :科研和臨床金標(biāo)準(zhǔn)
TRF分析也稱作端粒的Southern印跡法,是應(yīng)用針對端粒重復(fù)序列的探針來檢測限制性酶切后所保留的端粒的方法。
限制性酶會(huì)將基因組DNA消化為短的片段, 留下大量完好的端粒,即所謂的端粒限制性片段。
以凝膠電泳分離基因組片段 ,通過放射性探針 (CCCTAA)。
QPCR法檢測端粒長度:操作簡便,用時(shí)短,適用于批量檢測
端粒為染色體末端GGGATT 6堿基重復(fù)序列 ,設(shè)計(jì)PCR引物十分困難(二聚體不可避免),也無法設(shè)計(jì)Taqman探針。
2002年, Richard通過引物中引入突變 ,減少二聚體的產(chǎn)生,成功利用SYBR Green染料法測定端粒的相對長度。
翼和總體設(shè)計(jì)方案:雙重?zé)晒?/span>QPCR
? 利用SYBR green 染料檢測端粒擴(kuò)增產(chǎn)物
? 利用VIC熒光標(biāo)記的Uniprimer(發(fā)夾型)引物,檢測內(nèi)參基因擴(kuò)增產(chǎn)物
優(yōu)點(diǎn):擴(kuò)增效率高,體系穩(wěn)定性強(qiáng),消除孔間差異,減小誤差。
端粒擴(kuò)增產(chǎn)物量遠(yuǎn)高于內(nèi)參基因的擴(kuò)增產(chǎn)物,因此內(nèi)參基因擴(kuò)增產(chǎn)物中SYBR green 參入產(chǎn)生的熒光可忽略。
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