Mich單鏈DNA定量檢測(cè)試劑盒:高靈敏度熒光法原理與操作指南
一、技術(shù)原理
Mich單鏈DNA定量檢測(cè)試劑盒基于熒光染料與單鏈DNA(ssDNA)的特異性結(jié)合實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)。其核心原理如下:
熒光染料結(jié)合機(jī)制
試劑盒中的熒光染料(如SYBR Green I類(lèi)似物)可嵌入單鏈DNA的堿基對(duì)間,形成穩(wěn)定的染料-DNA復(fù)合物。當(dāng)染料與單鏈DNA結(jié)合時(shí),其熒光信號(hào)顯著增強(qiáng)(通常增強(qiáng)100-1000倍),而游離染料的熒光極弱。通過(guò)檢測(cè)熒光強(qiáng)度,可間接反映單鏈DNA的濃度。
非特異性結(jié)合的局限性
需注意,該染料對(duì)雙鏈DNA(dsDNA)和RNA也可能產(chǎn)生弱結(jié)合信號(hào),但試劑盒通過(guò)優(yōu)化染料濃度和反應(yīng)體系,優(yōu)先檢測(cè)單鏈DNA。若樣本中存在大量雙鏈DNA或RNA,需通過(guò)預(yù)處理(如加熱變性)將其轉(zhuǎn)化為單鏈形式,或選擇特異性更高的探針?lè)ㄔ噭┖小?br />
標(biāo)準(zhǔn)曲線法定量
通過(guò)已知濃度的單鏈DNA標(biāo)準(zhǔn)品(如1-200 ng范圍)建立標(biāo)準(zhǔn)曲線,將待測(cè)樣本的熒光信號(hào)與標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)比,計(jì)算樣本濃度。
二、操作指南
1. 實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備
試劑盒組分
濃縮檢測(cè)試劑(含熒光染料)
稀釋緩沖液
預(yù)稀釋的DNA標(biāo)準(zhǔn)品(1-200 ng范圍)
專(zhuān)用檢測(cè)管(推薦使用Mich Assay Tube,避免側(cè)壁標(biāo)注干擾熒光信號(hào))
儀器與耗材
熒光計(jì)或熒光酶標(biāo)儀(需支持485 nm激發(fā)/520 nm發(fā)射波長(zhǎng))
移液器(覆蓋1-20 μL和100-200 μL量程)
DNase-free耗材(避免核酸酶污染)
樣本要求
樣本體積:1-20 μL
濃度范圍:50 pg/μL - 200 ng/μL(檢測(cè)范圍1-200 ng)
兼容性:可耐受鹽、游離核苷酸、溶劑、去污劑或蛋白等污染物,但需避免強(qiáng)酸強(qiáng)堿或高濃度變性劑(如尿素、甲酰胺)。
2. 實(shí)驗(yàn)步驟
試劑與樣本準(zhǔn)備
將試劑盒組分恢復(fù)至室溫(25℃)。
輕輕顛倒混勻檢測(cè)試劑,瞬時(shí)離心(避免渦旋振蕩產(chǎn)生氣泡)。
準(zhǔn)備標(biāo)準(zhǔn)品:取10 μL標(biāo)準(zhǔn)品1(10 ng/μL)和標(biāo)準(zhǔn)品2(100 ng/μL)分別加入檢測(cè)管,補(bǔ)加190 μL稀釋緩沖液至終體積200 μL。
樣本檢測(cè)
取180-199 μL稀釋緩沖液加入樣本檢測(cè)管,加入1-20 μL待測(cè)樣本(終體積200 μL)。
輕輕渦旋振蕩3-5秒,避免產(chǎn)生氣泡。
室溫避光孵育2分鐘,使染料與單鏈DNA充分結(jié)合。
熒光信號(hào)讀取
將檢測(cè)管放入熒光計(jì),選擇“ssDNA High Sensitivity”檢測(cè)程序。
記錄熒光信號(hào)值,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算樣本濃度。
3. 注意事項(xiàng)
熒光淬滅控制
染料易受光降解,實(shí)驗(yàn)全程需避光操作(如使用鋁箔包裹檢測(cè)管)。
檢測(cè)工作液配制后需在3小時(shí)內(nèi)完成檢測(cè),避免熒光信號(hào)衰減。
標(biāo)準(zhǔn)品與樣本處理
標(biāo)準(zhǔn)品需上下顛倒混勻后瞬時(shí)離心,避免沉淀影響濃度準(zhǔn)確性。
樣本若含高濃度鹽或去污劑,建議用稀釋緩沖液進(jìn)行1:10預(yù)稀釋。
污染防控
使用DNase-free耗材,避免核酸酶降解樣本。
實(shí)驗(yàn)區(qū)域需分區(qū)操作(如配液區(qū)、樣本處理區(qū)、檢測(cè)區(qū)),防止交叉污染。
三、技術(shù)優(yōu)勢(shì)
高靈敏度
可檢測(cè)低至50 pg/μL的單鏈DNA,適用于痕量樣本(如循環(huán)腫瘤DNA、病毒基因組)的定量分析。
寬檢測(cè)范圍
線性檢測(cè)范圍達(dá)1-200 ng,覆蓋大多數(shù)實(shí)驗(yàn)需求(如NGS文庫(kù)構(gòu)建、qPCR模板定量)。
操作簡(jiǎn)便
無(wú)需復(fù)雜純化步驟,直接混合樣本與檢測(cè)工作液即可讀數(shù),單次檢測(cè)耗時(shí)<5分鐘。
污染物耐受性強(qiáng)
對(duì)鹽、蛋白、去污劑等常見(jiàn)污染物耐受閾值高,減少樣本預(yù)處理步驟。
四、Mich單鏈DNA定量檢測(cè)試劑盒應(yīng)用場(chǎng)景
基因編輯與合成生物學(xué)
定量評(píng)估CRISPR-Cas9編輯后單鏈DNA修復(fù)模板的濃度。
液態(tài)活檢
檢測(cè)血漿中循環(huán)游離DNA(cfDNA)的單鏈片段比例,輔助腫瘤早期診斷。
NGS文庫(kù)構(gòu)建
優(yōu)化文庫(kù)投入量,確保Illumina等平臺(tái)建庫(kù)成功率。
病毒學(xué)研究
定量分析病毒基因組單鏈RNA(如HIV、HCV)逆轉(zhuǎn)錄后的單鏈DNA中間體。
相關(guān)產(chǎn)品
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