代謝組學(xué):三羧酸循環(huán)中間代謝物精準(zhǔn)檢測(cè)
三羧酸循環(huán)系列檢測(cè)主要基于代謝組學(xué)分析技術(shù),結(jié)合高效液相色譜 - 質(zhì)譜聯(lián)用(HPLC-MS/MS)、氣相色譜 - 質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)等方法,對(duì)三羧酸循環(huán)中的關(guān)鍵中間代謝物(如檸檬酸、異檸檬酸、α- 酮戊二酸、琥珀酸、富馬酸、蘋(píng)果酸等)進(jìn)行定性和定量分析。
其核心原理是利用不同代謝物在色譜柱中的保留行為差異實(shí)現(xiàn)分離,再通過(guò)質(zhì)譜檢測(cè)器對(duì)分離后的代謝物進(jìn)行特異性識(shí)別和定量。通過(guò)比較樣品中這些中間代謝物的含量變化,可反映三羧酸循環(huán)的代謝活性及相關(guān)生理病理狀態(tài)。
儀器與試劑
(一)儀器
高效液相色譜 - 串聯(lián)質(zhì)譜儀(HPLC-MS/MS):配備合適的色譜柱(如 C18 柱,2.1mm×150mm,3.5μm)、自動(dòng)進(jìn)樣器、柱溫箱等。
氣相色譜 - 質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-MS):配備毛細(xì)管色譜柱(如 DB-5MS,30m×0.25mm×0.25μm)、電子轟擊離子源(EI)等。
高速冷凍離心機(jī)(轉(zhuǎn)速≥15000r/min,溫度可調(diào)控至 4℃)。
超聲波提取儀。
氮吹儀。
超純水制備系統(tǒng)(如 Milli-Q 系統(tǒng))。
天平(精度為 0.0001g)。
移液器(10μL、100μL、1mL、5mL 等)。
離心管(1.5mL、10mL、50mL)。
容量瓶(1mL、10mL、50mL、100mL 等)。
微孔濾膜(0.22μm,有機(jī)相和水相)。
(二)試劑
三羧酸循環(huán)中間代謝物標(biāo)準(zhǔn)品:檸檬酸、異檸檬酸、α- 酮戊二酸、琥珀酸、富馬酸、蘋(píng)果酸等,純度均≥98%。
甲醇:色譜純。
乙腈:色譜純。
甲酸:色譜純。
乙酸銨:分析純,用于配制流動(dòng)相緩沖液。
正己烷:色譜純。
叔丁基甲醚:色譜純。
內(nèi)標(biāo)物:如氘代檸檬酸(citric acid-d4)、氘代琥珀酸(succinic acid-d6)等,純度≥98%。
超純水:由超純水制備系統(tǒng)制備。
標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制
單標(biāo)儲(chǔ)備液的配制:分別準(zhǔn)確稱(chēng)取一定量的各三羧酸循環(huán)中間代謝物標(biāo)準(zhǔn)品,用甲醇 - 水(體積比 50:50)混合溶液溶解并定容,配制成濃度為 1.0mg/mL 的單標(biāo)儲(chǔ)備液,置于 - 80℃冰箱中避光保存,有效期為 3 個(gè)月。
混合中間液的配制:分別準(zhǔn)確移取一定體積的各單標(biāo)儲(chǔ)備液,用甲醇 - 水(體積比 50:50)混合溶液稀釋定容,配制成濃度為 100μg/mL 的混合中間液,置于 - 20℃冰箱中避光保存,有效期為 1 個(gè)月。
系列工作標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制:準(zhǔn)確移取不同體積的混合中間液,加入適量?jī)?nèi)標(biāo)物(使內(nèi)標(biāo)物濃度保持恒定),用甲醇 - 水(體積比 50:50)混合溶液稀釋?zhuān)渲瞥蓾舛葹?0.1ng/mL、1ng/mL、10ng/mL、50ng/mL、100ng/mL、500ng/mL、1000ng/mL 的系列工作標(biāo)準(zhǔn)溶液,現(xiàn)配現(xiàn)用。
樣品處理
(一)樣品采集與保存
動(dòng)物組織樣品:采集所需動(dòng)物組織(如肝臟、心肌等),迅速用預(yù)冷的生理鹽水沖洗去除血液,濾紙吸干水分,切成小塊,放入液氮中快速冷凍,然后轉(zhuǎn)移至 - 80℃冰箱中保存。
細(xì)胞樣品:收集對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞,用預(yù)冷的 PBS 緩沖液洗滌 2-3 次,離心(1000r/min,4℃,5min)棄上清,加入適量液氮冷凍,-80℃冰箱保存。
植物樣品:采集植物組織(如葉片、果實(shí)等),洗凈后用濾紙吸干水分,液氮冷凍后,-80℃冰箱保存。
(二)樣品提取
稱(chēng)取約 50mg 冷凍樣品置于 1.5mL 離心管中,加入 500μL 預(yù)冷的甲醇 - 水(體積比 80:20)提取液(含內(nèi)標(biāo)物),用組織研磨儀在低溫下研磨至勻漿。
超聲提取 30min(功率 300W,溫度 4℃),然后在 15000r/min、4℃條件下離心 15min,取上清液置于另一離心管中。
向殘?jiān)屑尤?300μL 上述提取液,重復(fù)超聲提取和離心步驟,合并兩次上清液。
(三)凈化與濃縮
向合并的上清液中加入 200μL 正己烷,渦旋混合 1min,12000r/min、4℃離心 10min,棄去上層有機(jī)相,保留下層溶液。
將下層溶液轉(zhuǎn)移至氮吹管中,用氮吹儀在 30℃下吹至近干,加入 200μL 甲醇 - 水(體積比 50:50)混合溶液復(fù)溶,渦旋混合 1min。
15000r/min、4℃離心 10min,取上清液通過(guò) 0.22μm 微孔濾膜(水相)過(guò)濾,濾液置于進(jìn)樣瓶中,待測(cè)。
檢測(cè)條件
(一)HPLC-MS/MS 檢測(cè)條件
色譜條件
色譜柱:C18 柱(2.1mm×150mm,3.5μm)。
柱溫:30℃。
流動(dòng)相:A 相為 0.1% 甲酸水溶液,B 相為乙腈。
梯度洗脫程序:0-3min,5% B;3-10min,5%-30% B;10-15min,30%-95% B;15-18min,95% B;18-18.1min,95%-5% B;18.1-22min,5% B。
流速:0.3mL/min。
進(jìn)樣量:5μL。
質(zhì)譜條件
離子源:電噴霧離子源(ESI),正負(fù)離子模式切換。
離子源溫度:350℃。
噴霧電壓:正離子模式 4000V,負(fù)離子模式 3500V。
鞘氣壓力:35psi。
輔助氣壓力:10psi。
碰撞氣壓力:1.5mTorr。
檢測(cè)模式:多反應(yīng)監(jiān)測(cè)(MRM),各代謝物的母離子、子離子、碰撞能量等參數(shù)根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)品優(yōu)化確定。
(二)GC-MS 檢測(cè)條件(針對(duì)部分揮發(fā)性代謝物)
色譜條件
色譜柱:DB-5MS 毛細(xì)管柱(30m×0.25mm×0.25μm)。
進(jìn)樣口溫度:250℃。
載氣:氦氣(純度≥99.999%),流速 1.0mL/min。
進(jìn)樣方式:分流進(jìn)樣,分流比 5:1。
進(jìn)樣量:1μL。
柱溫程序:初始溫度 60℃,保持 2min;以 8℃/min 升溫至 200℃,保持 3min;再以 15℃/min 升溫至 280℃,保持 5min。
質(zhì)譜條件
離子源:電子轟擊離子源(EI),電子能量 70eV。
離子源溫度:230℃。
接口溫度:280℃。
質(zhì)量掃描范圍:m/z 50-500。
溶劑延遲:3min。
檢測(cè)模式:選擇離子監(jiān)測(cè)(SIM),根據(jù)各代謝物標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)譜圖確定特征離子。
測(cè)定步驟
儀器預(yù)熱:打開(kāi) HPLC-MS/MS 或 GC-MS 儀器,進(jìn)行預(yù)熱,確保儀器各項(xiàng)性能參數(shù)穩(wěn)定。
標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制:將系列工作標(biāo)準(zhǔn)溶液按濃度由低到高的順序注入儀器,每個(gè)濃度重復(fù)進(jìn)樣 3 次,記錄各代謝物和內(nèi)標(biāo)物的峰面積。以各代謝物濃度與內(nèi)標(biāo)物濃度的比值為橫坐標(biāo),各代謝物峰面積與內(nèi)標(biāo)物峰面積的比值為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。
樣品測(cè)定:將處理好的樣品溶液注入儀器,按照上述檢測(cè)條件進(jìn)行測(cè)定,記錄樣品中各代謝物和內(nèi)標(biāo)物的峰面積。每個(gè)樣品重復(fù)進(jìn)樣 3 次,取平均值。
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