目錄:上海乾思生物科技有限公司>>細(xì)胞>>細(xì)胞系>> BY-1362CHO-JJ-9-H3K181a中國倉鼠卵巢細(xì)胞系
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更新時(shí)間:2025-08-08 09:58:46瀏覽次數(shù):277評(píng)價(jià)
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來源與構(gòu)建:該細(xì)胞系以 CHO-K1 為親本,通過 CRISPR/Cas9 介導(dǎo)的堿基編輯技術(shù)實(shí)現(xiàn) H3K181 位點(diǎn)的定點(diǎn)修飾,篩選獲得 H3K181a 修飾穩(wěn)定異常的單克隆株(“JJ-9-H3K181a" 標(biāo)識(shí)構(gòu)建批次、克隆編號(hào)與靶標(biāo)修飾位點(diǎn))。構(gòu)建過程中未引入外源抗性基因,通過 Western blot 與質(zhì)譜驗(yàn)證,確保 H3K181a 修飾水平較野生型改變 40%-60%,且其他組蛋白位點(diǎn)修飾無顯著變化(如 H3K4me3、H3K27ac 波動(dòng)<5%),避免非特異性表觀遺傳干擾。
形態(tài)與增殖:體外培養(yǎng)呈上皮樣形態(tài),貼壁生長時(shí)細(xì)胞輪廓清晰,較野生型 CHO 略大且排列疏松;因染色質(zhì)功能改變,懸浮培養(yǎng)適應(yīng)性較差,主要以貼壁方式培養(yǎng)。37℃、5% CO?條件下,增殖周期約 38-44 小時(shí),較野生型延長 8-10 小時(shí),適應(yīng)含 10% 胎牛血清的 DMEM/F12 培養(yǎng)基,傳代 60 次以上 H3K181a 修飾表型穩(wěn)定(波動(dòng)<7%),凍存復(fù)蘇后存活率超 83%。
功能特征:核心優(yōu)勢在于組蛋白修飾的特異性改變:H3K181a 修飾異常導(dǎo)致染色質(zhì)開放度改變(ATAC-seq 顯示 12% 的基因組區(qū)域 accessibility 變化),其中啟動(dòng)子區(qū)開放度差異zui顯著(上調(diào)區(qū)域占 8%,下調(diào)區(qū)域占 15%)。ChIP-seq 驗(yàn)證顯示,H3K181a 修飾與 RNA 聚合酶 II 結(jié)合效率呈正相關(guān)(R2=0.78),使下游靶基因(如細(xì)胞周期調(diào)控基因 CDK6)表達(dá)量改變 2-4 倍,wan美模擬組蛋白修飾介導(dǎo)的基因表達(dá)調(diào)控表型。
表觀遺傳調(diào)控機(jī)制研究
染色質(zhì)動(dòng)態(tài)分析
組蛋白靶向藥物篩選
貼壁培養(yǎng)操作:
復(fù)蘇:從液氮取出凍存管,37℃水浴 1-2 分鐘解凍,轉(zhuǎn)移至含 10mL 預(yù)熱培養(yǎng)基(DMEM/F12+10% 胎牛血清)的離心管,1000rpm 離心 5 分鐘,重懸后接種至 T75 培養(yǎng)瓶,37℃、5% CO?培養(yǎng)箱靜置培養(yǎng)。
換液:接種 24 小時(shí)后首ci換液,去除未貼壁細(xì)胞,此后每 48 小時(shí)換液一次,維持細(xì)胞融合度<70% 以保證表觀遺傳狀態(tài)穩(wěn)定。
傳代:當(dāng)細(xì)胞融合度達(dá) 60%-70% 時(shí),棄培養(yǎng)基,PBS 清洗 2 次,加入 2mL 細(xì)胞解離液,37℃孵育 3-4 分鐘,鏡檢細(xì)胞脫落后加入 8mL 培養(yǎng)基終止解離,按 1:4 比例傳代,避免過度密集導(dǎo)致修飾表型漂移。
修飾檢測樣本制備:
蛋白提?。喝?5×10?個(gè)細(xì)胞,用 RIPA 裂解液提取核蛋白,BCA 法定量后調(diào)整濃度至 1μg/μL。
修飾檢測:通過 Western blot 檢測 H3K181a 修飾水平(一抗選用特異性識(shí)別異常修飾的抗體),以總 H3 蛋白為內(nèi)參,計(jì)算相對(duì)表達(dá)量(建議每 20 代檢測一次以驗(yàn)證穩(wěn)定性)。
凍存流程:取對(duì)數(shù)生長期細(xì)胞,1000rpm 離心 5 分鐘,用凍存液(70% wan全培養(yǎng)基 + 20% 胎牛血清 + 10% DMSO)重懸至 5×10?個(gè) /mL,分裝至凍存管,程序降溫盒 - 80℃過夜,次日轉(zhuǎn)移至液氮保存,保存期可達(dá) 5 年以上,復(fù)蘇后需傳代 2-3 次再進(jìn)行表觀遺傳相關(guān)實(shí)驗(yàn)(確保修飾狀態(tài)穩(wěn)定)。
優(yōu)勢:H3K181a 修飾異常特異性高,其他組蛋白位點(diǎn)干擾<5%;表觀遺傳表型穩(wěn)定,傳代 60 次修飾水平波動(dòng)<7%;無外源基因整合,適合長期機(jī)制研究;對(duì)組蛋白修飾藥物響應(yīng)靈敏,篩選效率較野生型提升 35%。
局限性:部分基因表達(dá)改變可能間接受染色質(zhì)結(jié)構(gòu)影響(需結(jié)合 ChIP 驗(yàn)證直接調(diào)控關(guān)系);貼壁依賴性強(qiáng),懸浮培養(yǎng)會(huì)導(dǎo)致修飾表型改變(約 10%);部分實(shí)驗(yàn)需配套野生型對(duì)照(如 H3K181 正常修飾的 CHO 細(xì)胞)以排除背景干擾。
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