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目錄:上海乾思生物科技有限公司>>細(xì)胞>>細(xì)胞系>> BY-1363CHO-JJ-9中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞系

CHO-JJ-9中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞系

  • CHO-JJ-9中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞系
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  • 型號(hào) BY-1363
  • 廠商性質(zhì) 生產(chǎn)商
  • 所在地 上海市
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CHO-JJ-9中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞系,上皮樣,貼壁生長(zhǎng),組蛋白修飾調(diào)控改變,染色質(zhì)動(dòng)態(tài)異常,適用于表觀遺傳機(jī)制研究、染色質(zhì)功能分析及相關(guān)藥物篩選。
CHO-JJ-9中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞系
CHO-JJ-9中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞系是經(jīng)化學(xué)誘變篩選獲得的表觀遺傳研究模型,因組蛋白修飾調(diào)控網(wǎng)絡(luò)廣泛改變、染色質(zhì)動(dòng)態(tài)平衡失調(diào),成為研究泛組蛋白修飾介導(dǎo)的表觀遺傳調(diào)控、染色質(zhì)功能及相關(guān)藥物篩選的特色工具。其保留 CHO 細(xì)胞典型的上皮樣形態(tài)與貼壁生長(zhǎng)特性,同時(shí)因組蛋白整體調(diào)控異常,為解析多種組蛋白修飾協(xié)同作用機(jī)制提供了綜合性實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。
一、細(xì)胞來(lái)源與基本特性
  • 來(lái)源與篩選:該細(xì)胞系以 CHO-K1 為親本,通過(guò)亞硝ji胍化學(xué)誘變結(jié)合表觀遺傳表型篩選獲得。經(jīng)多輪單克隆純化,挑選出第 9 株組蛋白修飾譜改變zui顯著的克隆(“JJ-9" 標(biāo)識(shí)誘變批次與克隆編號(hào))。篩選過(guò)程未引入基因編輯,僅通過(guò)檢測(cè)組蛋白修飾整體水平(如乙?;⒓谆偤浚┐_定陽(yáng)性克隆,全基因組測(cè)序顯示與親本相似度>99.5%,確保遺傳背景的穩(wěn)定性。

  • 形態(tài)與增殖:體外培養(yǎng)呈上皮樣形態(tài),貼壁生長(zhǎng)時(shí)細(xì)胞鋪展均勻,較野生型 CHO 稍大且邊界清晰;因染色質(zhì)功能異常,懸浮培養(yǎng)易聚集成團(tuán)(直徑 50-100μm),故主要以貼壁方式培養(yǎng)。37℃、5% CO?條件下,增殖周期約 36-42 小時(shí),較野生型延長(zhǎng) 6-8 小時(shí),適應(yīng)含 10% 胎牛血清的 DMEM/F12 培養(yǎng)基,傳代 60 次以上組蛋白修飾異常表型穩(wěn)定(整體波動(dòng)<8%),凍存復(fù)蘇后存活率超 84%。

  • 功能特征:核心優(yōu)勢(shì)在于組蛋白修飾的廣泛性改變:整體組蛋白乙酰化水平較野生型升高 25%,甲基化水平降低 18%,導(dǎo)致全基因組染色質(zhì)開(kāi)放度顯著變化(ATAC-seq 顯示 18% 的基因組區(qū)域可及性改變),其中增強(qiáng)子區(qū)域開(kāi)放度差異最tu出(上調(diào)區(qū)域占 12%,下調(diào)區(qū)域占 15%)。ChIP-seq 驗(yàn)證顯示,多個(gè)組蛋白修飾(如 H3K4me3、H3K27ac)的分布模式改變,使涉及細(xì)胞代謝、應(yīng)激響應(yīng)的 843 個(gè)基因表達(dá)量出現(xiàn) 2-5 倍差異,模擬了復(fù)雜表觀遺傳擾動(dòng)下的基因調(diào)控表型。

二、核心應(yīng)用領(lǐng)域
  1. 泛表觀遺傳調(diào)控機(jī)制研究

該細(xì)胞系是解析多種組蛋白修飾協(xié)同作用的理想模型。通過(guò)多組學(xué)聯(lián)合分析(轉(zhuǎn)錄組 + 蛋白質(zhì)組 + 修飾組),鑒定出 126 個(gè)受組蛋白修飾網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的核心基因,其中 62% 的基因啟動(dòng)子區(qū)同時(shí)存在 3 種以上組蛋白修飾的共定位變化,證實(shí)組蛋白修飾間的交叉調(diào)控效應(yīng)。在細(xì)胞應(yīng)激實(shí)驗(yàn)中,其熱休克蛋白 HSP70 的誘導(dǎo)表達(dá)量較野生型降低 40%,伴隨 H3K9ac 在 HSP70 啟動(dòng)子區(qū)的富集減少,揭示組蛋白修飾網(wǎng)絡(luò)對(duì)環(huán)境響應(yīng)基因的調(diào)控機(jī)制。
  1. 染色質(zhì)整體動(dòng)態(tài)分析

因染色質(zhì)結(jié)構(gòu)廣泛改變,該細(xì)胞系可用于研究染色質(zhì)全局構(gòu)象與細(xì)胞功能的關(guān)聯(lián)。染色體構(gòu)象捕獲(Hi-C)實(shí)驗(yàn)顯示,其 A/B compartments 轉(zhuǎn)換頻率較野生型增加 22%,拓?fù)湎嚓P(guān)結(jié)構(gòu)域(TAD)邊界強(qiáng)度降低 15%,表明組蛋白修飾異常影響高階染色質(zhì)結(jié)構(gòu);在 DNA 復(fù)制時(shí)序分析中,晚期復(fù)制區(qū)比例增加 18%,證實(shí)染色質(zhì)動(dòng)態(tài)對(duì)基因組復(fù)制程序的調(diào)控作用,為理解染色質(zhì)組織的整體性提供新視角。
  1. 廣譜表觀遺傳藥物篩選

在藥物研發(fā)中,該細(xì)胞系可用于篩選調(diào)節(jié)整體組蛋白修飾的化合物。通過(guò)建立基于熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)的高通量檢測(cè)體系,同時(shí)監(jiān)測(cè)多種組蛋白修飾酶的活性變化,篩選準(zhǔn)確率達(dá) 87%。例如,在抗腫瘤藥物篩選中,其能同時(shí)識(shí)別影響組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶與去甲基化酶的多靶點(diǎn)化合物,使候選藥物的作用譜分析效率提升 40%,為多靶點(diǎn)表觀遺傳藥物開(kāi)發(fā)提供du特模型。
三、培養(yǎng)方法
  • 貼壁培養(yǎng)操作

  1. 復(fù)蘇:從液氮取出凍存管,37℃水浴 1-2 分鐘解凍,轉(zhuǎn)移至含 10mL 預(yù)熱培養(yǎng)基(DMEM/F12+10% 胎牛血清)的離心管,1000rpm 離心 5 分鐘,重懸后接種至 T75 培養(yǎng)瓶,37℃、5% CO?培養(yǎng)箱靜置培養(yǎng)。

  1. 換液:接種 24 小時(shí)后首ci換液,去除未貼壁細(xì)胞,此后每 48 小時(shí)換液一次,維持細(xì)胞融合度<70% 以保證表觀遺傳狀態(tài)穩(wěn)定。

  1. 傳代:當(dāng)細(xì)胞融合度達(dá) 60%-70% 時(shí),棄培養(yǎng)基,PBS 清洗 2 次,加入 2mL 細(xì)胞解離液,37℃孵育 3-4 分鐘,鏡檢細(xì)胞脫落后加入 8mL 培養(yǎng)基終止解離,按 1:4 比例傳代,避免過(guò)度密集導(dǎo)致修飾表型漂移。

  • 組蛋白修飾檢測(cè)

  1. 蛋白提?。喝?5×10?個(gè)細(xì)胞,用組蛋白提取試劑盒分離純化組蛋白,BCA 法定量后調(diào)整濃度至 1μg/μL。

  1. 修飾分析:通過(guò) Western blot 檢測(cè)總組蛋白乙?;⒓谆剑ㄟx用泛特異性抗體),或采用質(zhì)譜分析定量多種修飾類(lèi)型,建議每 15 代檢測(cè)一次以驗(yàn)證表型穩(wěn)定性。

  • 凍存流程:取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期細(xì)胞,1000rpm 離心 5 分鐘,用凍存液(70% wan全培養(yǎng)基 + 20% 胎牛血清 + 10% DMSO)重懸至 5×10?個(gè) /mL,分裝至凍存管,程序降溫盒 - 80℃過(guò)夜,次日轉(zhuǎn)移至液氮保存,保存期可達(dá) 5 年以上,復(fù)蘇后需傳代 2-3 次再進(jìn)行表觀遺傳相關(guān)實(shí)驗(yàn)(確保修飾狀態(tài)穩(wěn)定)。

四、優(yōu)勢(shì)與局限性
  • 優(yōu)勢(shì):組蛋白修飾改變范圍廣,可模擬復(fù)雜表觀遺傳擾動(dòng);表型穩(wěn)定,傳代 60 次整體修飾水平波動(dòng)<8%;無(wú)外源基因整合,保留天然表觀遺傳互作網(wǎng)絡(luò);適合多靶點(diǎn)藥物篩選,檢測(cè)效率較單一修飾模型提升 40%。

  • 局限性:修飾改變的復(fù)雜性使單一調(diào)控機(jī)制解析難度增加(需結(jié)合單修飾模型驗(yàn)證);貼壁依賴性強(qiáng),懸浮培養(yǎng)會(huì)導(dǎo)致修飾譜改變(約 12%);部分實(shí)驗(yàn)需配套多組學(xué)數(shù)據(jù)分析,技術(shù)門(mén)檻較高。

五、研究意義
CHO-JJ-9 細(xì)胞系的建立為泛表觀遺傳研究提供了綜合性模型,其組蛋白修飾網(wǎng)絡(luò)異常的特性推動(dòng)了對(duì)表觀遺傳調(diào)控整體性的理解。在基礎(chǔ)研究中,其助力闡明多種組蛋白修飾的協(xié)同作用及對(duì)染色質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的影響,為解析 “表觀遺傳網(wǎng)絡(luò)" 提供關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)依據(jù);在應(yīng)用領(lǐng)域,其作為復(fù)雜表觀遺傳擾動(dòng)的細(xì)胞替身,加速了多靶點(diǎn)表觀遺傳藥物的研發(fā)進(jìn)程,同時(shí)為疾病相關(guān)表觀遺傳標(biāo)志物的篩選提供了理想材料,是連接基礎(chǔ)表觀遺傳學(xué)與復(fù)雜疾病研究的重要橋梁。

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