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蛋白質(zhì)測(cè)序數(shù)據(jù)類型解析

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蛋白質(zhì)測(cè)序數(shù)據(jù)類型解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

蛋白測(cè)序通常指的是確定dànbáizhì的氨基酸序列。這涉及對(duì)dànbáizhì的氨基酸進(jìn)行排序,以確定它們?cè)赿ànbáizhì中的確切順序。蛋白測(cè)序的數(shù)據(jù)結(jié)果可以描述為以下數(shù)據(jù)類型:


1、氨基酸序列:

這是dànbáizhì測(cè)序的主要輸出,表示為一個(gè)由20種標(biāo)準(zhǔn)氨基酸單字母代碼組成的字符串。例如,一個(gè)小的蛋白片段可能有序列“MGSDKI".

Edman測(cè)序研究案例

圖1

2、質(zhì)譜圖數(shù)據(jù):

如果使用質(zhì)譜法進(jìn)行dànbáizhì測(cè)序,會(huì)獲得一個(gè)質(zhì)譜圖,顯示了不同的質(zhì)荷比和相對(duì)強(qiáng)度。這可以幫助確定氨基酸片段的質(zhì)量和組成。

從頭測(cè)序

圖2

3、覆蓋圖或映射:

這顯示了已經(jīng)確定序列的dànbáizhì片段是如何映射回到整個(gè)dànbáizhì的。這可以幫助研究者了解已經(jīng)確定了多少的dànbáizhì序列以及還有哪些區(qū)域尚未確定。

20221219-3038-肽段覆蓋率3.png

圖3


4、置信度得分:

對(duì)于每個(gè)確定的氨基酸位置,可能會(huì)有一個(gè)置信度得分,表明該位置的氨基酸標(biāo)識(shí)的確信程度。


5、其他注釋:

可能包括已知的翻譯后修飾、亞單位信息、已知的結(jié)構(gòu)域等。

通常,氨基酸序列數(shù)據(jù)可以存儲(chǔ)在簡(jiǎn)單的文本格式中,如FASTA格式。而質(zhì)譜圖數(shù)據(jù)通常會(huì)保存在專門的格式中,如.mzML、.mzXML或.raw格式。

蛋白質(zhì)測(cè)序數(shù)據(jù)類型解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

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