Top-Down蛋白質(zhì)組學在腫瘤標志物發(fā)現(xiàn)中的五大應用檢測技術服務詳情介紹

腫瘤標志物作為癌癥診療的重要分子指標，長期依賴蛋白組學技術的支持。然而，腫瘤本質(zhì)上是一種高度異質(zhì)性的疾病，其關鍵蛋白往往具有豐富的翻譯后修飾（PTMs）和變異異構體（proteoforms）。這些精細分子特征常常在Bottom-Updànbáizhì組學中被忽略，制約了腫瘤標志物的發(fā)現(xiàn)深度與jīngzhǔn度。Top-Downdànbáizhì組學是一種直接分析完整dànbáizhì（而非肽段）的質(zhì)譜技術，能夠保留dànbáizhì的翻譯后修飾（PTMs）、剪接變體和dànbáizhì異構體信息，通過直接分析完整dànbáizhì分子，實現(xiàn)dànbáizhì變體的全面解析，正成為破解腫瘤復雜性的重要工具。Bottom-Updànbáizhì組學雖然廣泛應用于腫瘤研究，但其“肽段為基礎"的策略難以保留完整dànbáizhì的信息，如剪切異構體、翻譯后修飾（PTMs）等，限制了其在jīngzhǔn標志物解析中的表現(xiàn)。相比之下，Top-Downdànbáizhì組學技術通過直接分析完整dànbáizhì分子，可在保持原始結構完整性的同時，jīngquè捕捉各種dànbáizhì異構體。這使其在腫瘤標志物發(fā)現(xiàn)中展現(xiàn)出dútè優(yōu)勢。

一、解析dànbáizhì異構體，揭示腫瘤異質(zhì)性本質(zhì)

Top-Down技術能直接分析dànbáizhì的全長序列和PTM組合，識別同源蛋白的不同變體（proteoforms）。例如，p53蛋白的不同磷酸化、乙酰化修飾狀態(tài)在腫瘤發(fā)生發(fā)展中具有wánquán不同的功能意義。Bottom-Up方法無法jīngzhǔn識別這些差異，而Top-Down方法則可區(qū)分并量化這些功能性變體，助力揭示腫瘤細胞表型背后的分子機制。

二、靶向低豐度蛋白，提升早期診斷靈敏度

許多具有潛力的腫瘤標志物（如循環(huán)腫瘤細胞分泌的信號蛋白）豐度極低、異構體多。Top-Downdànbáizhì組學結合高分辨質(zhì)譜與前處理富集策略，可在復雜背景下捕捉這些低豐度蛋白，尤其適用于血液、尿液等體液樣本，提升早期腫瘤篩查的特異性和靈敏度。

三、多位點修飾分析，賦能功能性標志物篩選

在癌癥進展中，許多關鍵蛋白同時攜帶多種翻譯后修飾（如磷酸化、泛素化、甲基化等）。Top-Down策略可同時解析這些修飾的空間組合，有助于區(qū)分“修飾指紋"對蛋白功能的調(diào)控，從而篩選出更具功能意義和臨床價值的候選標志物。

四、構建Proteoform圖譜，助力亞型分類與個體化治療

通過Top-Downdànbáizhì組學構建特定癌種的proteoform圖譜，有助于識別不同腫瘤亞型之間的關鍵分子差異。例如在乳腺癌研究中，不同proteoform模式已被用于區(qū)分ER陽性與HER2陽性亞型。這一策略為jīngzhǔn分型與靶向治療提供了分子依據(jù)。

五、結合AI算法，推動標志物大規(guī)模發(fā)現(xiàn)與驗證

當Top-Downdànbáizhì組數(shù)據(jù)與機器學習算法結合后，可在多組學背景中識別高價值生物標志物特征。數(shù)據(jù)驅(qū)動的模型不僅提高了候選標志物的識別效率，還提升了其跨平臺、跨人群的可重復性。隨著質(zhì)譜技術的通量提升，Top-Down策略正逐步向臨床轉(zhuǎn)化邁進。

Top-Downdànbáizhì組學在腫瘤標志物研究中展現(xiàn)出結構解析深度高、修飾識別能力強、異構體區(qū)分精細等dútè優(yōu)勢。作為一家專注于前沿蛋白組技術的科研服務企業(yè)，在百泰派克生物科技，我們整合高分辨率Orbitrap質(zhì)譜平臺、定制化富集方案與AI輔助分析流程，打造面向科研與臨床轉(zhuǎn)化的Top-Downdànbáizhì組學服務體系。期待與您共同推進腫瘤jīngzhǔn醫(yī)學的發(fā)展。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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