產(chǎn)品簡介
詳細介紹

應(yīng)用領(lǐng)域 | 1、基因編輯 2、CRISPR檢測6/管) |
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周期 | 快至1周 |
價格 | 3800元起 ; |


Spcas9 | Lbcas12a | Aapcas12b | Lbucas13a | Lwacas13a | |
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PAM/PFS | 5’-NGG-3’ | 5’-TTTV-3’ | 5’-TTN-3’ | None | None |
None | dsDNA | dsDNA or ssDNA | dsDNA or ssDNA | ssRNA | ssRNA |
Cis-cleavage | dsDNA | dsDNA or ssDNA | dsDNA or ssDNA | ssRNA | ssRNA |
Trans-cleavage | None | ssDNA | ssDNA | ssRNA | ssRNA |
SpCas9是一種依賴于sgRNA引導的 DNA內(nèi)切核酸酶。在靶標DNA存在PAM(5’-NGG-3’)的情況下,SpCas9 Nuclease能在sgRNA引導下特異性結(jié)合并切割靶標dsDNA,使DNA雙鏈斷裂并生成平末端。其切割位點位于目標序列target sequence內(nèi),距離PAM 3個堿基的位置。SpCas9不僅可用于基因編輯,還可應(yīng)用于體外靶標 DNA 的切割、目的片段的克隆等實驗。
LbCas12a是一種依賴crRNA介導的核酸內(nèi)切酶,在靶標雙鏈DNA存在PAM((5’-TTTV-3’)序列的情況下,LbCas12a能在crRNA介導下特異性識別并切割雙鏈DNA,而LbCas12a 特異性切割靶標單鏈DNA不依賴PAM序列。LbCas12a-crRNA復合物與互補dsDNA或ssDNA結(jié)合后,其非特異性ssDNA反式切割活性被激活,通過設(shè)計兩端標記熒光基團或其它小分子標記的Reporter ssDNA,可實現(xiàn)Cas12a對DNA模板的檢測和信號放大,可通過熒光儀和試紙條觀察結(jié)果。
AapCas12b核酸酶是一種依賴 sgRNA介導的核酸內(nèi)切酶,在靶標雙鏈DNA存在PAM(5’-TTN-3’)序列的情況下,由sgRNA介導特異性識別并切割雙鏈DNA,而AapCas12b特異性切割靶標單鏈DNA則不依賴PAM序列。AapCas12b-crRNA復合物與互補的dsDNA或者ssDNA結(jié)合后,其非特異性ssDNA反式切割活性被激活。AapCas12b的好的反應(yīng)溫度為60℃,因此適合與環(huán)介導等溫擴增(LAMP)聯(lián)用。
LbuCas13a是一種由crRNA介導的核酸內(nèi)切酶,對PAM(PFS)位點無依賴性。在crRNA識別并切割靶標RNA時,Lbucas13a的反式切割活性被激活,可非特異切割體系中單鏈 RNA(ssRNA)。通過設(shè)計兩端標記熒光基團或者其他標記物的RNA探針,可實現(xiàn)對RNA模板的檢測和信號放大,可通過熒光儀或試紙條觀察結(jié)果。
LwaCas13a是一種由crRNA介導的核酸內(nèi)切酶,與LbuCas13a一樣,對PAM(PFS)位點無依賴性。在crRNA識別并切割靶標RNA時,Lwacas13a的反式切割活性被激活,可實現(xiàn)對體系中的ssRNA的非特異切割。通過設(shè)計兩端標記熒光基團或者其他標記物的RNA探針,可實現(xiàn)CRISPR/Cas13a對RNA模板的檢測和信號放大。可通過熒光儀或試紙觀察結(jié)果。
通過活性測試,對比艾迪基因提供的基因編輯用酶與競品的性能。
反應(yīng)體系中添加待檢Target模板、Cas酶、crRNA和熒光探針,當crRNA與Cas酶組裝成功能復合物并識別Target模板后,會激活Cas酶的反式切割活性并切割熒光探針釋放出熒光信號,通過熒光值來反映酶的性能。左圖和右圖是分別針對Lbucas12a和Lwacas3a兩種酶進行測試,結(jié)果顯示,艾迪基因提供的酶的熒光強度更強,切割活性與靈敏性明顯更優(yōu)。



Cas12與guide RNA、target DNA結(jié)合后會被激發(fā)針對ssDNA的反式剪切活性;Cas13與guide RNA、target RNA結(jié)合后會被激發(fā)針對ssRNA的反式剪切活性;而Cas9暫未被報道反式剪切活性。
①RPA恒溫擴增試劑盒于-20℃保存,可長期存放。
②靶標質(zhì)??砷L期存放-20℃ ③ Cas蛋白反復凍融容易影響活性,建議分裝多管,存放-80℃,根據(jù)實驗需要取出使用。另外,短期內(nèi)使用的,可放-20℃保存。
③crRNA容易降解,建議短時間內(nèi)用不到的于-80℃保存。
④探針是DNA雙鏈,相對來說沒有那么容易降解,可放-20℃保存。
該產(chǎn)品被引用文獻
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